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Vom Benutzer bereitzustellende
Verbrauchsmaterialien
Verbrauchsmaterial
Alkoholtupfer,
70 % Isopropyl oder
Ethanol, 70 %
Ballonflasche,
Fassungsvermögen mindestens
6 Liter
250-ml-Zentrifugenröhrchen
Anbieter
VWR, Katalog-Nr. 95041-714
Allgemeiner Laborlieferant
Allgemeiner Laborlieferant
Konische 15-ml-Röhrchen
Konische 50-ml-Röhrchen, selbststehend (optional)
Einweg-Handschuhe, ungepudert
Labortücher, fusselfrei
Corning, Katalognummer 430776 SBS- und PE-Reagenzien-
Racks, Positionen mit PW1.
Gerätewaschlauf.
Corning, Katalognummer 430052 PE-Reagenzien-Racks,
Positionen mit PW1.
Gerätewaschlauf.
Sammeln und Messen der
Abfallvolumina.
Corning, Katalognummer 430921 Lagern der Fließzellen.
Allgemeiner Laborlieferant
VWR, Katalog-Nr. 21905-026
Zweck
Reinigen der Fließzelle und des Fließzellentisches.
Vorbereitung der Lösung für den Wartungswaschlauf.
Allgemeine Verwendung.
VWR, Katalog-Nr. 52846-001
Reinigen des
Fließzellenhalters.
Reinigen der Fließzelle.
Linsenpapier, 4 x 6 Zoll
(10,2 x 15,2 cm)
Pipettenspitzen, 200 µl Allgemeiner Laborlieferant
Pipettenspitzen, 1000 µl Allgemeiner Laborlieferant
Aufteilen von
Reagenzienvolumina.
Aufteilen von
Reagenzienvolumina.
Wartungswaschlauf.
ProClin 300, 50 ml
Tween 20, viskose Flüssigkeit,
100 ml
Pinzette, viereckige
Kunststoffspitze
Sigma-Aldrich, Katalog-Nr.
48912-U
Sigma-Aldrich, Katalog-Nr.
P7949
McMaster-Carr, Katalog-Nr.
7003A22
Wasser, Laborqualität, 18 M Ohm Millipore
Wartungswaschlauf.
Entfernen der Fließzellen-
Dichtungen.
SBS- und PE-Reagenzien-
Racks, Positionen mit PW1.
Gerätewaschlauf.
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Material-Nr. 20000063
Dokument-Nr. 15066496 v01 DEU
Kapitel 3 Vorbereiten von Reagenzien
Vorbereiten von Reagenzien
Vorbereiten von SBS-Reagenzien
Vorbereiten von Indizierungs- und Paired-End-Reagenzien
HiSeq 4000-Systemhandbuch
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Table of contents
- 8 Einleitung
- 9 Weitere Ressourcen
- 10 Gerätekomponenten
- 15 Überblick über die Sequenzierungs-Verbrauchsmaterialien
- 18 Starten des HiSeq 4000
- 19 Anpassen der Systemeinstellungen
- 21 Anzeigen und Senden von Gerätedaten
- 22 Vom Benutzer bereitzustellende Verbrauchsmaterialien
- 24 Einleitung
- 25 Vorbereiten von SBS-Reagenzien
- 26 Vorbereiten von Indizierungs- und Paired-End-Reagenzien
- 28 Einleitung
- 29 Sequenzierungsworkflow
- 30 Eingeben von Laufparametern
- 33 Laden und Vorfüllen von Reagenzien
- 38 Einsetzen der Sequenzierungsfließzelle
- 42 Überwachen des Laufs
- 43 Entladen von Reagenzien
- 44 Durchführen eines Wasserwaschlaufs
- 45 Durchführen einer Schnellformatierung des Ausgabelaufwerks
- 48 Durchführen eines Wartungswaschlaufs
- 51 Versetzen des Geräts in den Leerlauf
- 52 Ausschalten des Geräts
- 54 Protokolldatei
- 55 Mögliche Probleme bei der Laufkonfiguration
- 56 Durchführen einer Fluidikprüfung
- 57 Unterbrechen oder Beenden eines Laufs auf dem HiSeq 4000
- 59 Gestaffelte Läufe auf Fließzelle A und Fließzelle B
- 60 Mögliche Primer-Rehybridisierung für Read 1
- 62 Überblick über die Echtzeitanalyse
- 64 Echtzeitanalyse-Workflow
- 70 Sequenzierung von Ausgabedateien
- 71 Plattennummerierung